在经历了关原之战后的三十五年，日本逐渐迈向和平与稳定，然而一个可怕的威胁突然降临：一种名为“群凶”的怪物开始袭击人类，以血肉为食。为了应对这场灾难，幕府秘密派遣Specialist行动队，前去讨伐这些怪物，并在行动后将相关地区焚毁，试图掩盖真相。 远离战乱与纷争的多胡村，曾是一名忍者的女主角，现隐姓埋名成为一名医生助手，与没有血缘关系的养女一起过着平静的生活。有一天，为了寻找治愈疾病的药物，女主远行到一个村庄，却发现满布血迹与尸骨，遭遇血腥恐怖的“群凶”袭击。这时，她悲痛的往事再次浮现心头。为了保护自己如亲生女儿般珍视的养女，她踏上了一段未知的生死旅途。 与此同时，一个尚保有人类意识，但已经变成“半群凶”的男子，他名叫士郎，被世人孤立与歧视。他不知自己的身份与过去的故事，苦苦寻觅某个人的线索，希望揭开自己的身世谜团，踏上了寻找真相的旅程……